《瘋狂小怪獸》遊戲中一共有六大場景，分別是上古森林、奇跡之海、不朽炎山、穹頂巨石、暴雷平原和閉鎖空間。每個場景都有三種難度，每個難度有若干關卡：上古森林5關，奇跡之海、不朽炎山、穹頂巨石各10關，暴雷平原、閉鎖空間各15關，三種難度共有195關。
除了六大場景外還有一個比較特殊的組隊遊戲，當玩家每打通一個場景的劇情模式時，組隊遊戲中就會開啟與之對應的場景。在該場景中玩家可以和隊友一起攻關，有豐富的人物經驗、寵物經驗和道具經驗獎勵。
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