2029年，位於銀河聯邦中的「星雲共和國」國家安全局秘密啟動反人類計畫，試圖毀滅銀河聯邦中的所有反對勢力，計畫代號被命名為「變種人」。
陰謀隱密的執行到2038年的冬天，名為「噬靈」的病毒被偷偷帶出了安全局大樓，其幕後黑手，就是星雲共和國中勢力隻手遮天的財團─「星雲財團」。
星雲財團規劃了此次的病毒偷竊行動後，開始了對病毒的秘密研究，大量製造出帶原該病毒的「改造人」。
這整個研究一直持續著，直到神秘組織「夜行者」突襲星雲財團總部，獲取到該秘密病毒研究中名為「原命素301」的樣本，並讓其公諸於眾，才讓整起陰謀事件曝光。但病毒早已擴散，殭屍大戰一觸即發……
身屬於聯邦調查局的你發現了一艘不對勁的神秘戰機，潛入後在戰機的內部發現了強力的殭屍，卻在消滅了為數眾多的殭屍之後，踏入戰機中心的你發現了一艘可疑的機器，隨即與其展開了一場激烈的戰鬥。
沒想到戰鬥後爆炸的餘波衝擊到自身，當被聯邦政府救起時已經失去了所有的記憶，在聯邦政府的安排下，踏上解開這樁陰謀與找回記憶的戰鬥旅途……
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